企業體系運行三個月（特殊行業六個月）之后，就可以向認證機構提出認證申請，申請材料包括：
1、 QMS體系（ISO9001）認證申請書
2、 質量管理體系手冊、程序文件
3、 企業簡介、組織機構圖、產品工藝流程圖、企業職能分配表
4、 有效的企業營業執照、組織機構代碼證
5、 如產品涉及相關行政許可的，應提供有效的相關證明（如：資質證書、工業生產許可證、衛生許可證、QS證書、CCC證書等）
6、 如企業產品涉及多現場生產或安裝，應提供多現場清單。
ISO9001認證所需資料
1.內審計劃、報告、檢查表。
2.管理評審計劃、管理評審報告、持續改進計劃；上一年完成情況；各部門的管理業績匯報。
3.質量目標完成情況統計表。（工藝紀律檢查表、重大設備完好表、主要產品優于國家標準統計表等）
4.上一年的不合格項的整改情況。
5.技術：所有設計產品最大規格的設計資料，包括所有的記錄資料；特殊過程驗證情況。
6.質檢：所有的生產記錄（包括試驗報告、排產單）。
7.供應：合格供方的管理（包括名錄、管理記錄、評價）；采購單；報檢單等。
8.公司辦：培訓的相關資料；任職評價；辦公設施清單；特行證；特種設備鑒定證；上崗證等。
9.設備：點檢記錄；維修計劃、記錄、評價等。
10.銷售：合同及評審記錄；售后評價、記錄等。
11.銷售：2份合同及所有的記錄。
12.消防器材的有效期。
13.生產現場：標識及現場管理咨詢。
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